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Référencement et réception des échantillons

La plateforme peut recevoir soit des matériels biologiques soit des ADN déjà purifiés. Les échantillons sont référencés dans le LIMS (Laboratory Information Management System) avant leur arrivée sur la plateforme de service, où ils sont étiquetés avec un code unique généré par le LIMS (étiquette code à barres). D’autres options de référencement sont possibles, comme l’étiquetage par le client avant l’envoi des échantillons.

La procédure de transport des échantillons biologiques et la température de conservation à réception sont définies avec le client, en conformité avec les règles de biosécurité et de biosûreté (voir le règlement de service, consultable sur demande).

Extraction et purification des ADN

Les matériels biologiques sont extraits selon une méthode convenue avec le client, automatisée ou manuelle selon les cas. Pour plus de précisions concernant les offres d’extractions et les matériels biologiques pris en charge, consulter la rubrique extractions.

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Contrôle qualité des ADN

Tous les échantillons d’ADN extraits par la plateforme subissent un contrôle qualité permettant de connaître a minima la quantité d’ADN extrait. Pour les ADN purifiés envoyés par le client, cette prestation est optionnelle, et modulable.

En routine, la quantité et la qualité de chaque échantillon ADN sont déterminées par trois mesures, de manière automatisée et en interface avec le LIMS :

  • Mesure de l’absorbance par spectrophotométrie UV entre 220 et 320nm (spectre) et détermination des rapports de DO A260/A280, A260/A230
  • Mesure de l’émission de fluorescence en présence d’un fluorophore spécifique de l’ADN double brin. Cette mesure est utilisée pour calculer les volumes d’aliquotage.
  • Migration électrophorétique sur gel d’agarose non dénaturant.

La combinaison de ces analyses permet de savoir si l’ADN est en assez grande quantité pour satisfaire la demande, s’il est pur et de haut poids moléculaire. Les volumes à aliquoter par capsule sont calculés par défaut en fonction de la concentration obtenue par mesure de fluorimétrie, spécifique de l’ADN double brin.

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Aliquotage des ADN

Cette opération entièrement automatisée permet de répartir chaque échantillon d’ADN selon la quantité ou le volume d’ADN par capsule et/ou le nombre de minicapsules demandés par le client.

Lors de cette opération, le code à barres de chaque échantillon d’ADN est associé aux codes Datamatrix de ses minicapsules et les informations sont automatiquement enregistrées dans le LIMS.

Dessiccation des ADN

Au cours de cette étape, les échantillons subissent une déshydratation primaire par le vide dans un évapo-concentrateur permettant de maîtriser les différents paramètres de séchage (descente en pression, température de l’enceinte).

Encapsulation des ADN

Après l’étape de dessiccation primaire, les portoirs d’étuis d’ADN ainsi que les bouchons sont introduits dans une enceinte garantissant un environnement contrôlé (anoxique, anhydre) et inerte (argon, hélium).

Sous cette atmosphère, à l’abri des facteurs d’altération, l’étui et le bouchon de chaque minicapsule sont assemblés et scellés par soudage Laser YAG pulsé pour une étanchéité rigoureuse, sans élévation de température.Sexy Imprimer Workout Fitness Mince Womens Moulante Lettre Acheter CqxwptvA

Chaque minicapsule subit après soudage, un contrôle d’étanchéité systématique effectué par un détecteur de fuites (détection d’hélium par spectrométrie de masse), permettant de garantir une étanchéité rigoureuse. En cas de fuite détectée, l’échantillon est ré-encapsulé.

Livraison des minicapsules

Les minicapsules sont livrées sur leurs portoirs de stockage à l’adresse indiquée par le client ou stockées pour compte sur la plateforme. Les données de correspondance entre les identifiants du client et les codes 2D des minicapsules (et les données de contrôle qualité le cas échéant), sont également exportées de la base de données du LIMS et fournies lors de la livraison.

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